Usa (*.png) o (*.jpg), es indiferente a excepción de si quieres hacer postproducción. Tamaño PAL es un buen tamaño, o más pequeño, escalando proporcionalmente.
Flash admite video, lo humilde a formato (*.flv) o lo puedes dejar dentro del swf, no es necesario cargar una secuencia, es más, no es lo más recomendable.
Puedes usar max o Cinema, los dos funcionan muy bien, si además te instalas el Vray en cualquiera de ellos mejor.