Sugerencias con modelos stl abiertos

Buenas, acudo a vosotros porque estoy realizando mi trabajo final de grado de ingeniería el cual consiste en la simulación aerodinámica de diferentes coches por ordenador. Para esto he cogido diferentes modelos de Internet, pero todos presentan el mismo problema, tienen agujeros que hacen que al mallar, esta se cuele dentro del coche. Es decir, el programa de simulación acaba simulando el interior y el exterior del coche a causa de que los modelos no son impermeables falseando las simulaciones. He probado con MeshLab, polyMender, netfabb etc, pero o no consigo tener una superficie cerrada o me distorsiona completamente la geometría (o ambas). Hay que señalar también que mi nivel en esto es prácticamente nulo puesto que el único diseño por ordenador que he tocado en ingeniería ha sido más enfocado al diseño de planos que otra cosa, así que, si alguien pudiese echarme un cable le estaría enormemente agradecido. Muchas gracias por su tiempo de antemano.