Hola the Bones. Hay una forma que a lo mejor te puede ayudar. Dentro de Photoshop te vas al menú archivo en automatizar te vas abajo del todo donde pone PhotoMerge.
Una vez abierta la ventana selecciona si quieres archivo o carpeta entera y le das a examinar. Te vas dónde tienes los renders y seleccione todos los archivos que quieres importar. Le das ok y empezara a procesarlas. Luego se te abrirá otra ventana y verás en el panel derecho, abajo, una opción que te pone mantener como capas. La seleccione y le das ok.
Con esto tendrías todos los archivos por capas.
Espero te valga. Un saludo.